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allgemeine phylogenetik

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Jeff 2024-07-13 18:05:05 +02:00
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47
allgphylo.tex Normal file
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@ -0,0 +1,47 @@
% allgphylo.tex
\section{Beriffe der Phylogenetik}
\begin{description}
\item[Art (Biospecies)] reproduktiv voneinander isolierte Organismengruppen, einzige natürliche Einheit
\item[Monophylum] Gruppe, die alle Nachkommen nur einer Stammart und diese Stammart enthält. Zeigt mindestens eine Apomorphie
\item[Schwestergruppe (Adelphotaxa)] zwei monopyhletische Taxa mit einem, nur ihnen gemeinsamen Vorfahren. Zwei Schwestergruppen und ihr gemeinsamer Vorfahr bilden ein Monophylum
\item[Apomorphie] transformiertes (abgeleitetes) Merkmal
\begin{description}
\item[Autapomorphie] description
\item[Snyapomorphie] description
\end{description}
\item[Plesiomorphie] unverändert beibehaltenes Merkmal, belegt nicht die Existenz exklusiv gemeinsamer Vorfahren
\item[Paraphylum] Gruppierung, die auf Symplesiomorphien begündet ist. Behinhaltet nicht unbedingt alle Nachkommen des letzen gemeinsamen Vorfahren
\item[Polyphylum] Gruppierung, die auf Konvergenzen (unabhänig voneinander entstandenen gemeinsamen Merkmalen) beruht
\end{description}
\begin{table}
\sffamily
\begin{tabularx}{0.9\textwidth}{|r|c|X|}
\hline
\textbf{Taxon} & \textbf{Endung} & \textbf{Beispiel}
\\ \hline
Reich & -ota & Eukaryota (Eukaryoten)
\\
Abteilung & -phyta & \;\textSFii\textSFx\, Spermatophyta (Samenpflanzen)
\\
Unterabteilung & -phytina & \quad\textSFii\textSFx\, Magnoliophytina (Bedecktsamer)
\\
Klasse & -opsida\footnote{-phycaea für Algen, -mycetes für Pilze} & \quad\quad\textSFii\textSFx\, Rosopsida (Eudikotyledonen)
\\
Unterklasse & -idae\footnote{-phycidae für Algen, -mycetidae für Pilze} & \quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, Rosidae (Rosenähnliche)
\\
Ordnung & -ales & \quad\quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, Rosales (Rosenartige)
\\
Familie & -ceae & \quad\quad\quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, Rosaceae (Rosengewächse)
\\
Unterfamilie & -oidaea & \quad\quad\quad\quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, Rosoidaea
\\
Gattung & & \quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, \emph{Rosa} (Rose)
\\
Art & & \quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, \emph{Rosa canina} (Hundsrose)
\\ \hline
\end{tabularx}
\caption[Übersicht der phyologenetischen Hierarchieebenen in der Botanik]{Übersicht der phyologenetischen Hierarchieebenen in der Botanik am Beispiel der Hundsrose}
\label{tab:phylolevels}
\end{table}

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45
compendium.tex
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@ -2,7 +2,7 @@
\input{jjpackages.tex}
\usepackage{pmboxdraw} % provides agled lines for tab:phylolevels
\usepackage{pmboxdraw} % provides angled lines for tab:phylolevels
%opening
\title{Botanik \& Systematik der Pflanzen}
@ -52,17 +52,12 @@
\section{Embryophyten: Moose und Kormopyhten}
\input{embryophten.tex}
\section{Kormophyten}
\section{Kormophyten: Farnpflanzen und Spermatophyten}
\input{kormophyten.tex}
\section{Hemikormophyten, Farne und Farnartige}
\section{Spermatophyten: Gymnospermen und Angiospermen}
\section{Spermatophytina/Samenpflanzen} \label{sec:spermatophytina}
\section{Gymnospermen}
\section{Angiospermen}
\section{Angiospermen: basale Dikotyle, Monokotyle und Eudikotyledonen}
\section{Dikotyledonen und Eudikotyledonen}
@ -70,37 +65,7 @@
\pagebreak
\part[Allgemeiner Teil: Phylogenetik]{Allgemeine Phylogenetik}
\begin{table}
\sffamily
\begin{tabularx}{0.9\textwidth}{|r|c|X|}
\hline
\textbf{Taxon} & \textbf{Endung} & \textbf{Beispiel}
\\ \hline
Reich & -ota & Eukaryota (Eukaryoten)
\\
Abteilung & -phyta & \;\textSFii\textSFx\, Spermatophyta (Samenpflanzen)
\\
Unterabteilung & -phytina & \quad\textSFii\textSFx\, Magnoliophytina (Bedecktsamer)
\\
Klasse & -opsida\footnote{-phycaea für Algen, -mycetes für Pilze} & \quad\quad\textSFii\textSFx\, Rosopsida (Eudikotyledonen)
\\
Unterklasse & -idae\footnote{-phycidae für Algen, -mycetidae für Pilze} & \quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, Rosidae (Rosenähnliche)
\\
Ordnung & -ales & \quad\quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, Rosales (Rosenartige)
\\
Familie & -ceae & \quad\quad\quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, Rosaceae (Rosengewächse)
\\
Unterfamilie & -oidaea & \quad\quad\quad\quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, Rosoidaea
\\
Gattung & & \quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, \emph{Rosa} (Rose)
\\
Art & & \quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad\textSFii\textSFx\, \emph{Rosa canina} (Hundsrose)
\\ \hline
\end{tabularx}
\caption[Übersicht der phyologenetischen Hierarchieebenen in der Botanik]{Übersicht der phyologenetischen Hierarchieebenen in der Botanik am Beispiel der Hundsrose}
\label{tab:phylolevels}
\end{table}
\input{allgphylo.tex}
\end{document}

14
embryophten.tex
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@ -1,6 +1,11 @@
% embryophten.tex
Zu den Embryophyten gehört neben der paraphyletischen Gruppe der "Bryophyten" (Moose) die Großgruppe der der Kormophyten oder Tracheophyten (Gefäßpflanzen).
Zu den Embryophyten gehört neben der Großgruppe der Kormophyten oder Tracheophyten (Gefäßpflanzen) die Gruppen der paraphyletischen Einheit der "Bryophyten" (Moose):
\begin{compactitem}
\item Marchantiophytina (Lebermoose); möglicherweise zwei unabhängige Entwicklungslinien: thallose und foliose Lebermoose
\item Bryophytina (Laubmoose)
\item Anthocerotophytina (Hornmoose)
\end{compactitem}
\paragraph{Synapomorphien der Embryophyten}
\begin{compactitem}
@ -12,13 +17,6 @@ Zu den Embryophyten gehört neben der paraphyletischen Gruppe der "Bryophyten" (
\item heterophasisch, heteromorpher Generationswechsel
\end{compactitem}
\paragraph{Die Bryophyten sind eine paraphyletische Gruppe mit drei oder vier Entwicklungslinien}
\begin{compactitem}
\item Marchantiophytina (Lebermoose); möglicherweise zwei unabhängige Entwicklungslinien: thallose und foliose Lebermoose
\item Bryophytina (Laubmoose)
\item Anthocerotophytina (Hornmoose)
\end{compactitem}
\paragraph{Plesiomorphien der Bryophten}
\begin{compactitem}
\item heterophasisch, heteromorpher Generationswechsel mit dominierender haploider Gametophytengeneration (= grüne Moospflanze). Der diploide Sporophyt (= Sporogon) ist einfacher gebaut und nicht selbstständig Lebensfähig, er wird vom Gametophyten ernährt.

4
jjpackages.tex
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@ -21,6 +21,8 @@
% ### MISC #############################
\usepackage[table]{xcolor}
\usepackage{hyperref}
% \usepackage[implicit=false]{hyperref} % disable color conversions for printing
\hypersetup{
@ -50,7 +52,7 @@
\usepackage{lmodern} %modern font-family
%\usepackage{mathptmx} %times ff that also works in math mode
\usepackage[table]{xcolor}
\definecolor{paragraphcol}{RGB}{27, 90, 132}

52
kormophyten.tex
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@ -1,6 +1,14 @@
% kormophyten.tex
Kormophyta = Tracheophyta
Zu den Kormophyten (= Tracheophyten) gehören neben den Spermatophyten (samenbildenden Kormophyten) die folgenden Gruppen, die zur paraphyletischen Gruppe der Pteridophyten (sporenbildende Kormophyten) zusammengefasst werden, wobei die Spermatophyten eine Schwestergruppe zu den Lycopodiophytina bilden:
\begin{compactitem}
\item Lycopodiophytina (Bärlappgewächse)
\item Psilotphytina inkl. Ophioglossales (Urfarne)
\item Equisetophytina (Schachtelhamlgewächse)
\item Marattiophytina (Eusporangiate Farne)
\item Filicophytina (Leptosporangiate Farne)
\item Spermatophytina (Samenpflanzen)
\end{compactitem}
\paragraph*{Synapomorphien der Kormophyten}
\begin{compactitem}
@ -15,33 +23,45 @@ Kormophyta = Tracheophyta
\paragraph{Wuchsformen der Kormophyten}
\paragraph{Zu den Kormophyten gehören folgende Gruppen:}
\begin{compactitem}
\item Psilotphytina inkl. Ophioglossales (Urfarne)
\item Equisetophytina (Schachtelhamlgewächse)
\item Marattiophytina (Eusporangiate Farne)
\item Filicophytina (Leptosporangiate Farne)
\item Spermatophytina (Samenpflanzen) (\cref{sec:spermatophytina})
\end{compactitem}
\subsection{Lycopodiophytina (Bärlappgewächse)}
\begin{compactitem}
\item 1100-1200 Arten
\item 1100 – 1200 Arten
\item rezent nur noch relikartig vertreten, im Paläozoikum wichtige Waldbildner
\item ober- und unterirdische Achsen gabelig verzweigt, Sprossachsen mit Aktinostelen oder Plektostelen mit exarchem Protoxylem
\item einfache Mikrophylle (aus Emergenzen entstanden und nachträglich mit Leitbündeln versorgt)
\item Sporangien in den Achsel oder auf der adaxialen Pberfläche der mikrophyllen Sporophylle
\end{compactitem}
\paragraph{Gliederung der Unterabteilung Lycopodiophytina}
\item Man unterscheidet:
\begin{compactitem}
\item Ordnung: Lycopodiales (Bärlappe im engeren Sinn), 400 Arten
\item Ordnung: Selaginellales (Moosfarne), 700 Arten
\item Ordnung: Lycopodiales (Bärlappe im engeren Sinn): 400 Arten, immergrüne Kräuter, meist feuchte Biotope, Mikrophylle ohmne Ligula, Isosporangien meist in endständigen Sporophyllständen
\item Ordnung: Selaginellales (Moosfarne): 700 Arten, eine einzige Gattung \emph{Selaginella}, immergrüne Kräzer, meist vierzeilig (kreuzgegenständig) beblättert, Mikrophylle mit Ligula, Achsengabelungen oft mit Wurzelträgern, Hetreosporangien in endständigen Sporophyllständen, Megasporophylle meißt im unteren, Mikrosporophylle im oberen Zapfenteil
\item Ordnung: Isoetales (Brachsenkräuter), 70 Arten
\end{compactitem}
\end{compactitem}
\subsection{Psilotphytina inkl. Ophioglossales (Urfarne)}
\subsection{Equisetophytina (Schachtelhamlgewächse)}
\begin{compactitem}
\item 15 – 25 Arten, rezent nur noch mit der einzigen Gattung \emph{Equisetum} reliktartig vertreten
\item Achsen unterteilt in Nodien und lange längsberillte Internodien gegliedert, an den Nodien wirtelig stehende Mikrophylle und Seitenzweige, die zu einer Stängelumfassenden Blattscheide verwachsen sind
\item Mikrophylle sind durch Reduktion entstanden
\item Assimilation überwiedgend über Halme
\item unterirdische Rhizome mit Adventivwurzeln
\item hohle Internodien mit Markhöhle, Carinalkanäle in den eustelischen Leitbündeln und Vallekularkanäle in der Rinde
\item rezente Taxa ohne sekundäres Dickenwachstum
\item Isosporangien sitzen an tischchenförmigen Sporangienträgern, die in zapfenförmigen Sporophyllständen stehen
\item Sporen mit bandförmigen, zu hygroskopischen Bewegungen fähigen Anhängen (Hapteren)
\end{compactitem}
\subsection{Marattiophytina (Eusporangiate Farne)}
\begin{compactitem}
\item Hauptverbreitung im Karbon, ca. 200 rezente Arten in einziger Ordnung Marattiales
\item Isosporangien im reifen Zustand mit mehrschichtiger Wand (eusporangiat), Bildung von großen Sporenmengen
\item langlebiger Gametophyt
\end{compactitem}
\subsection{Filicophytina (Leptosporangiate Farne)}
\begin{compactitem}
\item
\end{compactitem}